Теоретический вопрос для биоХимиков

T55M
1. Почему спираль РНК распадается?
2. Какая причина/свойство нуклеидов заставляет их цепляться к цепочке РНК?

Статью Вики "Гипотеза мира РНК"читал, по ссылкам ходил.

Все равно не понятно.

Прошу помощи.

Gladiator
T55M
1. Почему спираль РНК распадается?
2. Какая причина/свойство нуклеидов заставляет их цепляться к цепочке РНК?
В обоих случаях - за счет водородных связей: между цитозином и гуанином (Ц-Г), между аденином и урацилом (А-У) и между гуанином и урацилом (Г-У).
T55M
Благодарю за ответ!

вопрос, что запускает процесс комплементарного присоединения?
почему спираль РНК начинает расплетаться на "промоторы"?

Gladiator
T55M
почему спираль РНК начинает расплетаться на "промоторы"?
Под воздействием РНК-полимеразы, которая обладает хеликазной активностью.
T55M
Gladiator
Под воздействием РНК-полимеразы, которая обладает хеликазной активностью.

Еще раз благодарю!

почему включается полимераза? в какой момент она включается? есть какой то сложный механизм, или, он однотактовый, типа, "температура повысилась" или "время пришло"?

Gladiator
T55M
почему включается полимераза? в какой момент она включается? есть какой то сложный механизм, или, он однотактовый, типа, "температура повысилась" или "время пришло"?
Полимераза запускается после достижения достаточной для инициации концетрации факторов транскрипции - особых белков, количество которых (как абсолютное, так и удельное) возрастает с ростом размера генома.

Чем старше становится клетка - тем активнее она делится (но одновременно тем больше возрастает количество ошибок во время копирования коданов нуклеиновой кислоты)

Низкоспециализированная (раковая) клетка в основном отличается от высокоспециализированной (здоровой) клетки тем, что она начинает активно делиться - не успев достичь достаточной зрелости...

T55M
Если позволите, я еще вопросы позадаю. Вглубь химии.
Gladiator
Постараюсь ответить на которые смогу - я ведь все-таки врач, а не химик 😊
T55M
есть такая гипотеза как "Химическая эволюция", в рамках которой обосновывается за свойство веществ к усложнению и самоорганизации.

Типа, сначала гелий, потом водород, потом всякие углероды и кислороды и на выходе, в настоящем времени с одной стороны советская лунно-посадочная пилотируемая программа Н-1-Л3, ну или интервью с маньяком.

Отдельными высоколобыми не без основания декларируется, что этот процесс подчинен фундаментальным физическим взаимодействиям, а конкретно - электромагнитному.
И вот никак у меня не получается протянуть цепочку рассуждений от физики к условным ионам и радикалам. Типа, сначала ковалентные связи, и только потом не ковалентные? а почему? какая зависимость? "Кто на ком сидел?" - не могу сформулировать. А требуется уложиться в 4-6 строк.

из ближайшего свойства вижу свойство к достижению 8-электронной валентной оболочки, тн "октетное число Льюиса", стр. 8 "Основы теории реакционной способности органических соединений". здесь https://portal.tpu.ru/SHARED/e...D0%BE%D1%81%D1% 82%D1%8C.pdf

Гоминид
процесс подчинен фундаментальным физическим взаимодействиям, а конкретно - электромагнитному.
Согласно обобщённой теореме Ирншоу (верность которой современной наукой не подвергается сомнению) не может существовать стабильной системы частиц, взаимодействующих электромагнитным образом. То есть не может существовать ничего сложнее атома.
T55M
блин
T55M
Гоминид
Согласно обобщённой теореме Ирншоу (верность которой современной наукой не подвергается сомнению) не может существовать стабильной системы частиц, взаимодействующих электромагнитным образом. То есть не может существовать ничего сложнее атома.

что такое "стабильная система"? в каком периоде? кирпич в стене Кремля существует уж 500 лет, достаточно стабильно.

Штангер
есть такая гипотеза как "Химическая эволюция", в рамках которой обосновывается за свойство веществ к усложнению и самоорганизации.
Точно так. Молекула формальдегида, при определенных условиях начинает "усложняться" и полимеризуется до углеводородов. От простого к сложному. Примерно тоже самое происходит и с аминокислотами. Они соединяются в цепочки белков, белки за счет водородных связей скручиваются в спирали, спирали закручиваются в глобулы, и далее все усложняется, организуется некая самостоятельная химическая система. Она стремится поддерживать некое равновесие, некое постоянство, в зависимости от свойств окружающей среды. Подстраиваться, изменяться, усложняться, присоединять к себе одни аминокислоты, или отторгать другие, в зависимости от внешних условий. На некотором этапе усложнения начинает проявлять свойства самостоятельного "живого" субьекта.
Штангер
Типа, сначала ковалентные связи, и только потом не ковалентные?
Деление на ковалентные и ионные связи весьма условно по сути. Как и понятие числовой степени окисления. Можно лишь сказать, что одни элементы оттягивают электроны сильнее, а другие слабее.
ryzhov
Штангер
Молекула формальдегида, при определенных условиях начинает "усложняться" и полимеризуется до углеводородов.
Под "усложнением" можно понимать такое понятие как компенсация. Тоесть для сохранения постоянства и стабильности одних качеств (те-же ковалентные и ионные связи в молекуле ДНК), структура меняет другие "не важные" качества ( Меняется внешняя структура и форма ДНК). За счет чего меняется внешняя форма? Тут как раз хорошо видно условность ковалентных и не ковалентных связей, или отсутствие видимой дискретности в процессе перераспределения энергии (в этой ситуации). В лазерах компенсация протекает дискретно.


T55M
что такое "стабильная система"? в каком периоде?
Вечность. При условии отсутствия внешних воздействий.

T55M
в качестве шутки, пока бой Поветкина не начался


Можно объяснить все очень просто. Представим себе одно вещество как школьника с айфоном последней версии, в новой и дорогой одежде и т.д. Он оказывается в среде-катализаторе, например на окраине города, в плохо освещенном дворе. В этой среде есть другое вещество, в нашем случае гопники. У них в карманах есть свободное место для одной из составляющих школьника-элемента, а именно айфона. И они вступают с ним в реакцию. Связь школьника с айфоном не такая сильная и более сильный элемент обрывает ее и забирает молекулу-айфон себе. Среда-катализатор, темный двор, не изменился, но поспособствовал заметному ускорению реакции.
На следующий день школьник оказывается в другой среде и контактирует с элементом-мама. Связь "мама+деньги" не такая устойчивая, поэтому она теряет деньги, которые получает элемент-школьник. Дальше следует реакция "школьник+деньги+продавец+айфон" в среде-катализаторе "магазин М-Видео".

T55M
Штангер
Точно так. Молекула формальдегида, при определенных условиях начинает "усложняться" и полимеризуется до углеводородов. От простого к сложному. Примерно тоже самое происходит и с аминокислотами. Они соединяются в цепочки белков, белки за счет водородных связей скручиваются в спирали, спирали закручиваются в глобулы, и далее все усложняется, организуется некая самостоятельная химическая система. Она стремится поддерживать некое равновесие, некое постоянство, в зависимости от свойств окружающей среды. Подстраиваться, изменяться, усложняться, присоединять к себе одни аминокислоты, или отторгать другие, в зависимости от внешних условий. На некотором этапе усложнения начинает проявлять свойства самостоятельного "живого" субьекта.

Вот тут и наблюдается (мной, возможно, ошибочно) расширяющийся разрыв между Физикой - условно, "Вселенная стремится повысить энтропию -; тепловая смерть", и БиоХимией "От коацерватов к Луноходу".

ryzhov
T55M
Вот тут и наблюдается (мной, возможно, ошибочно) расширяющийся разрыв между Физикой - условно, "Вселенная стремится повысить энтропию -; тепловая смерть", и БиоХимией "От коацерватов к Луноходу".



Да. Я бы сказал что наблюдается разрыв между теорией и практикой.
Например физики говорят что вселенная расширяется. Математика тихо шепчет в кулак что это не возможно.
Если наша вселенная конечна, а за её границей "ни что", до факт расширения в ничто с математической точки зрения абсолютно равнозначен постоянному прибавлению нуля к пространству. Если вселенная бесконечна, то понятно что бесконечность не может расширятся. Бесконечность нельзя увеличить ни на метр пространства.
А вот деление пространства в постоянном объеме во внутрь "в себя" объясняет многие парадоксы расширяющейся вселенной. Точно так-же образуется наш организм после слияния сперматозоида и яйцеклетки. Увеличение размера нашего организма совершенно ничтожно по сравнению с увеличением количества наших клеток. У птиц и рептилий эта разница еще менее выражена.
Возможно представления древних о том что мир вышел из яйца не так уж нелепы)))